佣金自由化是国际证券市场发展的必然趋势，目前世界主要的证券交易所绝大部分对佣金的收取都已采用自由协商制，虽然我国尚未实现完全的佣金自由化，但是我国现行的最高限额内向下浮动佣金制度，亦为投资者与证券公司在一定的范围内自行协商佣金收取标准提供了依据。

一般来说，作为机构投资者其一般都与证券公司就佣金的收取标准进行了协商确定，但作为普通的个人投资者，特别是新入市的投资者而言，因交易经验不足、权利意识不强，其既不知道证券公司收取佣金存在一定的幅度，甚至连证券公司如何收费都不清楚，所以更不会知道他有权利与证券公司自行协商确定佣金收取标准。而按照我国现行的法律、法规，不管是机构还是个人投资者，其与证券公司之间都是可以自行协商佣金收取标准的，只是标准的幅度范围必须在最高限额（3‰）内向下浮动。

从目前的情况来看，证券公司对于普通的个人投资者一般只提供格式文本，文中对佣金收取标准中采取模糊约定，如“按照有关法律法规及证券交易所的交易规则的规定收取佣金、代扣代缴原告的有关税费”等。这样的约定就可能导致证券公司单方按照最高限额标准收取佣金，并且可能擅自调整佣金收取标准，从而造成不同投资者存在不同的收费标准问题，造成投资者间的交易成本承担不公平，而一旦由此引发纠纷，证券公司的行为并不违法，投资者的权益也就难以受到保护和界定。

因此，投资者为避免类似问题的发生，需要提高自己的权利意识，在办理证券开户、交易等手续时应全面审阅你与证券公司之间的证券交易委托代理协议等法律文件，以明确其中是否存在佣金条款，对于佣金比例要与证券公司进行充分协商，并最终将双方协商的佣金标准以书面的形式确定下来，在交易完成后要及时到证券公司打印相应的交割单，一旦发现问题，要及时提出异议并积极与证券公司交涉，以维护自身的合法权益 。